MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 10004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019965	GT	3	6	572099	572104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019965	ACG	2	6	572125	572130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_019965	GTT	2	6	572156	572161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019965	GCC	2	6	572162	572167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_019965	CAG	2	6	572196	572201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019965	CG	3	6	573584	573589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_019965	CGA	3	9	575611	575619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_019965	GC	3	6	575626	575631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_019965	CGA	3	9	575669	575677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019965	GC	3	6	575684	575689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_019965	CGCC	2	8	575725	575732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1012	NC_019965	TGG	2	6	575743	575748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019965	GCAT	2	8	575808	575815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_019965	GCC	2	6	576487	576492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_019965	ACC	2	6	576531	576536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_019965	CGG	2	6	576538	576543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_019965	GAG	2	6	576568	576573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019965	GA	3	6	576617	576622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019965	CGG	2	6	577402	577407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_019965	CGG	2	6	577411	577416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019965	GT	3	6	577485	577490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019965	CGA	3	9	578795	578803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019965	CAC	2	6	578830	578835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_019965	TGA	2	6	578859	578864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_019965	CGA	3	9	578872	578880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_019965	CAC	2	6	578907	578912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_019965	TGA	2	6	578936	578941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019965	CGA	3	9	578949	578957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_019965	GAG	3	9	578974	578982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019965	GTTT	2	8	584518	584525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019965	CTG	2	6	584570	584575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019965	CA	4	8	586499	586506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_019965	ACCAGT	2	12	589181	589192	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019965	GCCG	2	8	589532	589539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_019965	AAG	2	6	589672	589677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019965	GCT	2	6	589713	589718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019965	CGC	2	6	589802	589807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_019965	CTC	3	9	593532	593540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_019965	TCG	2	6	593561	593566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_019965	CTC	3	9	593590	593598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_019965	TCG	2	6	593619	593624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019965	TGCC	2	8	594588	594595	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_019965	TGC	2	6	594606	594611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_019965	TGGC	2	8	594654	594661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_019965	TCG	2	6	594719	594724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_019965	TTC	2	6	594806	594811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019965	GCTA	2	8	594835	594842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_019965	TAC	2	6	594862	594867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_019965	AGG	2	6	594885	594890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019965	CG	3	6	594919	594924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_019965	GGT	2	6	598612	598617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_019965	CCGA	2	8	602737	602744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_019965	GCT	3	9	604645	604653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_019965	GTA	2	6	604687	604692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_019965	GCC	2	6	606801	606806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_019965	AAG	2	6	606821	606826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_019965	GAC	2	6	609129	609134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019965	GC	3	6	609184	609189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_019965	CGG	2	6	609228	609233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_019965	CAG	2	6	609244	609249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019965	TCG	3	9	609298	609306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_019965	GGT	2	6	609310	609315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019965	GTCC	2	8	609331	609338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_019965	GCA	2	6	610342	610347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019965	GAA	2	6	610358	610363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019965	ATG	2	6	610429	610434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019965	GTC	2	6	610451	610456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1074	NC_019965	CGG	2	6	612594	612599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_019965	GGT	2	6	612635	612640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019965	GAG	2	6	612717	612722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_019965	GAC	2	6	612992	612997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_019965	GTC	2	6	615630	615635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_019965	CG	3	6	619087	619092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1101	NC_019965	C	6	6	630715	630720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1102	NC_019965	TGG	2	6	630756	630761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019965	GGCCG	2	10	630775	630784	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1104	NC_019965	CGA	2	6	630820	630825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_019965	GCAGG	2	10	636501	636510	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_019965	CAG	3	9	636511	636519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_019965	CCGG	2	8	636533	636540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1116	NC_019965	GCT	2	6	641101	641106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1118	NC_019965	GCG	2	6	641184	641189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_019965	CGG	2	6	641902	641907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_019965	CGCC	2	8	641915	641922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1121	NC_019965	CGG	2	6	641988	641993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_019965	CAGAT	2	10	642044	642053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1123	NC_019965	CGGCC	2	10	647250	647259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1124	NC_019965	CAG	2	6	649467	649472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_019965	CAG	2	6	654824	654829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1131	NC_019965	TGGC	2	8	655802	655809	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1133	NC_019965	CGG	2	6	655889	655894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_019965	CGG	2	6	754439	754444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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